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[实验相关] 细胞色素P450数据库

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请问各位老师,真菌要注释CYP450酶有专门的数据库吗?文献里看到的http://drnelson.uthsc.edu/CytochromeP450.html好像不能用呀?也找不到下载数据库的地方?请各位老师多多赐教呀
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    发表于 2019.5.12 14:39:27 | 显示全部楼层

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     楼主| 发表于 2019.5.12 16:22:59 | 显示全部楼层
    雷神之锤哦 发表于 2019.5.12 14:39
    http://p450.riceblast.snu.ac.kr/

    这个数据库本地比对后是这个样子,看不到它属于那个家族,我是全基因组找CYP450
    g79.t1  HCBG_09081 [Histoplasma capsulatum G186AR]      26.101  318     165     12      25      321     273     541     1.32e-17        84.0
    g86.t1  Clama_scaffold_5-4.0 [Cladonia macilenta]       35.238  210     90      5       99      270     10672   10873   1.50e-27        114
    g90.t1  Hanno_04867 [Heterobasidion annosum 03012]      25.410  122     79      4       14      131     733     846     2.22e-06        47.4
    g98.t1  OAT00923.1 [Blastomyces dermatitidis ER-3]      27.244  312     184     9       86      385     258     538     1.27e-21        97.8
    g110.t1 gm1.11142_g [Sphaerobolus stellatus]    27.600  250     150     6       12      235     180     424     4.20e-25        110
    g110.t1 gm1.11142_g [Sphaerobolus stellatus]    29.333  225     133     5       25      226     88      309     5.17e-21        97.1
    g110.t1 gm1.11142_g [Sphaerobolus stellatus]    34.694  98      62      2       12      107     329     426     5.05e-08        55.8

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    发表于 2019.5.12 16:49:39 | 显示全部楼层
    uyghbo 发表于 2019.5.12 16:22
    这个数据库本地比对后是这个样子,看不到它属于那个家族,我是全基因组找CYP450
    g79.t1  HCBG_09081 [His ...

    自己解决
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    发表于 2019.5.14 12:51:50 | 显示全部楼层

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    http://bioinfo.cau.edu.cn/CYPSI/links.htm
    看看这个网址有没有,或者自己在谷歌一下,找找数据库或者问下
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